高度化推進事業は、私立大学における研究基盤の整備及び研究機能の高度化を図るため、研究プロジェクトに対して重点的かつ総合的な支援を行うものである。

本事業の区分として、「ハイテク・リサーチ・センター整備事業」、「学術フロンティア推進事業」、「バイオ・ベンチャー研究開発拠点整備事業、産学連携研究推進事業」、「オープン･リサーチ･センター整備事業」がある。

戦略的研究基盤形成支援事業は、私立大学が、各大学の経営戦略に基づいて行う研究基盤の形成を支援するため、 研究プロジェクトに対して重点的かつ総合的に補助を行う事業である。
本事業の支援区分として、「研究拠点を形成する研究」、「地域に根差した研究」「大学の特色を活かした研究」がある。

※ハイテク・リサーチ・センター整備事業…文部科学省が、私立大学の優れた研究組織を選定し、そこで行われる理工・情報系及び生物・医歯系の分野における最先端の研究プロジェクトをハイテク・リサーチ・センター整備事業として支援している。

※原子力研究所は、平成14年3月1日付けで、量子科学研究所へ改称した。※学術フロンティア推進事業…文部科学省が、優れた研究実績をあげ,将来の研究発展が期待される卓越した私立大学の研究組織を選定し、そこで行われている他研究機関との共同研究を学術フロンティア推進事業として支援している。

※バイオ・ベンチャー研究開発拠点整備事業…文部科学省が、バイオテクノロジーの分野において、優れた研究実績を有する私立大学の研究組織を選定し、そこで行われる産学共同研究プロジェクトをバイオ・ベンチャー研究開発拠点整備事業として支援している。

※ベンチャー研究開発拠点整備事業･･･文部科学省が、ライフサイエンス、情報通信、環境分野において、優れた研究実績を有し、成果の実用化をめざした産学共同研究プロジェクトを行う私立大学の研究組織を選定し、そこで行われるベンチャー企業等との産学共同研究をベンチャー研究開発拠点整備事業として支援している。

※産学連携研究推進事業･･･文部科学省が、ベンチャー企業や地域企業（大企業を含む）等との有機的な連携の下で、産学共同研究を行う私立大学の研究組織を選定し、そこで行われる成果の実用化を目指す研究や萌芽的研究、地場産業の振興に係る産学共同プロジェクトを産学連携研究推進事業として支援している。

※オープン･リサーチ･センター整備事業･･･文部科学省が、多様な人材を受け入れたり、研究成果を広く公開するなど、オープンな体制の下に、 研究を推進する優れた私立大学の研究組織を選定し、そこで行われるプロジェクトをオープン・リサーチ・センター整備事業として支援している。